溴酸鹽離子色譜柱用于分離陽離子樣品，陰離子交換柱用作分離陰離子樣品。緩沖溶液作為洗脫液，經泵輸送入色譜柱后，其陽離子或陰離子zui終將溴酸鹽離子色譜柱中所有可交換的離子置換出來，同時由檢測器轉換為恒定的信號——基線。然后，進樣少量樣品，樣品離子即被樹脂柱所接受，并與等同數量的洗脫液離子交換。
如果樣品中所有離子的濃度大于洗脫液的離子濃度，那么在柱頂端的總離子濃度就將增加，這就產生了一個脈動，當它沿著柱移動并通過電導檢測器時即得到一個正峰；反之，則獲得負峰。進樣后，洗脫液離子繼續不斷地經泵輸入色譜柱，對樹脂的可交換部位與樣品離子進行競爭，并且使樣品離子沿著柱子移動。由于樣品離子對交換樹脂有不同的親和能力，因而不同的樣品離子沿柱以不同的速度移動，zui后完成分離。
溴酸鹽離子色譜柱是離子色譜儀的核心部件之一，樣品中各種離子的分離均在色譜柱中完成，并且一般比常規液相色譜柱價格要貴很多。因此，對離子色譜柱的維護保養十分重要。
1、接離子色譜柱前確保系統已清洗干凈。溴酸鹽離子色譜柱在任何情況下不能碰撞、彎曲或強烈震動；很多單位的離子色譜儀是陰、陽離子混用的，因此，接色譜柱前，一定要保證整個離子色譜儀上的所有閥件或管路已清洗干凈，避免造成色譜柱堵塞。
2、確保色譜柱不進入顆粒物。樣品一定要經過預處理，去除顆粒物等會給泵和色譜柱帶來負擔的物質。
3、確保離子色譜柱不干燥。每天分析工作結束后，要清洗進樣閥中殘留的樣品，還要用適當的溶劑來清洗柱；若分析柱長期不使用，要參照色譜柱保存辦法，在沖洗干凈后，對陰離子柱要通入一定濃度的堿，并將色譜柱取下兩端密封保存。
4、確保色譜柱在一定壓力、流速條件下運行。儀器使用時一定要先檢查整個流動管路中是否有氣泡，如果有，需要先將氣泡排除后再將溴酸鹽離子色譜柱接上，防止將氣泡帶到色譜柱中。因為溴酸鹽離子色譜柱中裝填的樹脂顆粒很小，氣泡進入后將影響樹脂和樣品中離子的交換，同時氣泡也將影響基線的穩定性。
